Nel Settecento, prima che il corso del Reno si dirigesse verso le valli di Poggio Renatico, Sant'Agostino sorgeva sul vecchio argine ed era un piccolo borgo di poche case chiamato "Sant'Agostino delle Paludi". La situazione idraulica del luogo era piuttosto instabile: bisognerà attendere la disastrosa rotta del 1763, detta della Panfilia, per procedere all'inalveamento definitivo del Reno verso est, consentendo così all'area di essere abitata e coltivata in sicurezza. Sant'Agostino è comune autonomo dal 1816. E' da notare nella piazza principale del comune, il palazzo municipale costruito nel 1864 ed ornato di un porticato in stile neoclassico.
